有些物质的显微结构不是在普通光源下就能看见的，比如一些天然的生物物质(如叶绿素）在显微镜下是看不见组织结构的，比如改性沥青在普通光源下是看不清改性沥青粒子的。
荧光显微镜是以紫外线、蓝光、绿光等为光源，用以照射被检物体，使之发出荧光，然后在荧光显微镜下观察物体的发出荧光拜访的形状及其所在位置。根据荧光显微镜原来，我们也可人为对被观察对象进行荧光染色处理观察其形状大小等。
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